第三季开场，特勤组在一次追捕军火商行动中遭黑客攻击，所有通讯中断。危机解除后，总督派来一位新成员——前CIA分析师陈美玲。她以超强的情报整合能力迅速破获两起悬案，但与此同时，岛上开始出现针对特勤组成员的暗杀，目标精准到每个人下一次行动的时间和地点。线索全部指向陈美玲曾经的CIA项目“深网清道夫”。原来她在离职时带走了一份黑名单，里面有全美十二个情报商的犯罪证据。特勤组必须在48小时内决定：是交出陈美玲保平安，还是为了正义与整个情报系统为敌。
这一季把“阳光下的罪恶”拍出了新高度。陈美玲的加入像一颗不定时炸弹，团队化学反应炸裂。动作戏依旧过瘾，但文戏的紧张感甚至超过了枪战。
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缉私队长收到匿名举报，12小时内若不查出海关内鬼，一艘藏毒的货轮将安全入港。
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一个连球场都进不去的流浪球童，拿着捡来的旧球杆，在公开赛上把当时的球王逼入绝境。
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停战协议签署前最后72小时，朝韩双方为一个没有战略价值的高地展开疯狂争夺，伤亡者只为“多活三天”。
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一个虔诚的天主教徒在结婚前夕得知，未婚妻曾在战争中受过集体侵犯，他的信仰与爱情同时陷入了绝境。
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2012年班加西事件中，一名CIA当地雇员带着六名被困外交官穿越绿区，死里逃生。
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李卫入京升任巡抚，却意外卷入一场涉及皇粮亏空的惊天大案，昔日街头混混今陷权力漩涡。